Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FARP1Q9Y4F1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FARP1Q9Y4F1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FARP1Q9Y4F1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 340 ms