Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
NOP58Q9Y2X3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NOP58Q9Y2X3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NOP58Q9Y2X3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NOP58Q9Y2X3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms