Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A6Q9Y2P4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC27A6Q9Y2P4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A6Q9Y2P4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A6Q9Y2P4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A6Q9Y2P4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A6Q9Y2P4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A6Q9Y2P4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A6Q9Y2P4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A6Q9Y2P4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A6Q9Y2P4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A6Q9Y2P4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A6Q9Y2P4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A6Q9Y2P4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A6Q9Y2P4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A6Q9Y2P4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A6Q9Y2P4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A6Q9Y2P4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC27A6Q9Y2P4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC27A6Q9Y2P4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC27A6Q9Y2P4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A6Q9Y2P4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A6Q9Y2P4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A6Q9Y2P4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC27A6Q9Y2P4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A6Q9Y2P4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A6Q9Y2P4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A6Q9Y2P4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A6Q9Y2P4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A6Q9Y2P4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A6Q9Y2P4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC27A6Q9Y2P4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A6Q9Y2P4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A6Q9Y2P4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A6Q9Y2P4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A6Q9Y2P4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A6Q9Y2P4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms