Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
TRAPPC8Q9Y2L5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TRAPPC8Q9Y2L5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TRAPPC8Q9Y2L5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TRAPPC8Q9Y2L5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TRAPPC8Q9Y2L5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TRAPPC8Q9Y2L5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
TRAPPC8Q9Y2L5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TRAPPC8Q9Y2L5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
TRAPPC8Q9Y2L5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
TRAPPC8Q9Y2L5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRAPPC8Q9Y2L5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRAPPC8Q9Y2L5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
TRAPPC8Q9Y2L5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRAPPC8Q9Y2L5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRAPPC8Q9Y2L5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRAPPC8Q9Y2L5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TRAPPC8Q9Y2L5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TRAPPC8Q9Y2L5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TRAPPC8Q9Y2L5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
TRAPPC8Q9Y2L5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TRAPPC8Q9Y2L5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TRAPPC8Q9Y2L5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TRAPPC8Q9Y2L5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
TRAPPC8Q9Y2L5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TRAPPC8Q9Y2L5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TRAPPC8Q9Y2L5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TRAPPC8Q9Y2L5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TRAPPC8Q9Y2L5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
TRAPPC8Q9Y2L5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TRAPPC8Q9Y2L5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
TRAPPC8Q9Y2L5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
TRAPPC8Q9Y2L5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms