Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF6Q9Y252 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF6Q9Y252 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF6Q9Y252 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms