Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRPC6Q9Y210 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRPC6Q9Y210 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRPC6Q9Y210 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRPC6Q9Y210 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms