Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQM7

CAMK2A, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2AQ9UQM7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMK2AQ9UQM7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMK2AQ9UQM7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMK2AQ9UQM7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAMK2AQ9UQM7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAMK2AQ9UQM7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAMK2AQ9UQM7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAMK2AQ9UQM7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAMK2AQ9UQM7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CAMK2AQ9UQM7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAMK2AQ9UQM7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms