Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM33Q9UPN9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM33Q9UPN9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM33Q9UPN9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM33Q9UPN9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms