Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDV3Q9UKY7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDV3Q9UKY7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDV3Q9UKY7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms