Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF3C4Q9UKN8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF3C4Q9UKN8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GTF3C4Q9UKN8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GTF3C4Q9UKN8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms