Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EPHA6Q9UF33 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPHA6Q9UF33 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPHA6Q9UF33 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHA6Q9UF33 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms