Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MARCH4Q9P2E8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH4Q9P2E8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH4Q9P2E8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH4Q9P2E8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms