Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDH10Q9P2E7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDH10Q9P2E7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDH10Q9P2E7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PCDH10Q9P2E7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms