Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABI3Q9P2A4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABI3Q9P2A4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABI3Q9P2A4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms