Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED29Q9NX70 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED29Q9NX70 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms