Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX05

FAM120C, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM120CQ9NX05 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM120CQ9NX05 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM120CQ9NX05 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM120CQ9NX05 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM120CQ9NX05 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM120CQ9NX05 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM120CQ9NX05 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM120CQ9NX05 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM120CQ9NX05 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM120CQ9NX05 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM120CQ9NX05 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM120CQ9NX05 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM120CQ9NX05 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM120CQ9NX05 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM120CQ9NX05 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM120CQ9NX05 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM120CQ9NX05 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM120CQ9NX05 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM120CQ9NX05 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM120CQ9NX05 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms