Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV29

TMEM100, Transmembrane protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM100Q9NV29 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMEM100Q9NV29 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM100Q9NV29 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMEM100Q9NV29 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM100Q9NV29 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM100Q9NV29 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM100Q9NV29 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM100Q9NV29 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM100Q9NV29 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM100Q9NV29 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM100Q9NV29 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM100Q9NV29 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM100Q9NV29 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM100Q9NV29 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM100Q9NV29 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM100Q9NV29 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM100Q9NV29 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms