Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHST12Q9NRB3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHST12Q9NRB3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHST12Q9NRB3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHST12Q9NRB3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms