Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FSCN3Q9NQT6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FSCN3Q9NQT6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FSCN3Q9NQT6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FSCN3Q9NQT6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FSCN3Q9NQT6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FSCN3Q9NQT6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FSCN3Q9NQT6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FSCN3Q9NQT6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FSCN3Q9NQT6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FSCN3Q9NQT6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FSCN3Q9NQT6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FSCN3Q9NQT6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FSCN3Q9NQT6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FSCN3Q9NQT6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FSCN3Q9NQT6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FSCN3Q9NQT6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FSCN3Q9NQT6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FSCN3Q9NQT6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FSCN3Q9NQT6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FSCN3Q9NQT6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FSCN3Q9NQT6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FSCN3Q9NQT6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FSCN3Q9NQT6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FSCN3Q9NQT6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FSCN3Q9NQT6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FSCN3Q9NQT6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms