Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPRD1BQ9NQG5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPRD1BQ9NQG5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms