Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH2

ISYNA1, Inositol-3-phosphate synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISYNA1Q9NPH2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ISYNA1Q9NPH2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ISYNA1Q9NPH2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ISYNA1Q9NPH2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ISYNA1Q9NPH2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ISYNA1Q9NPH2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ISYNA1Q9NPH2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms