Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNB1IP1Q9NPC3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNB1IP1Q9NPC3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms