Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX9

VCX3A, Variable charge X-linked protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3AQ9NNX9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCX3AQ9NNX9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VCX3AQ9NNX9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VCX3AQ9NNX9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms