Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOPCQ9HD26 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GOPCQ9HD26 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GOPCQ9HD26 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GOPCQ9HD26 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOPCQ9HD26 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms