Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SRA1Q9HD15 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRA1Q9HD15 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRA1Q9HD15 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRA1Q9HD15 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRA1Q9HD15 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRA1Q9HD15 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRA1Q9HD15 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SRA1Q9HD15 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRA1Q9HD15 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.2 ms