Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
UPF2Q9HAU5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
UPF2Q9HAU5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UPF2Q9HAU5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms