Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC22A4Q9H015 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A4Q9H015 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC22A4Q9H015 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms