Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ROPN1BQ9BZX4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ROPN1BQ9BZX4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms