Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UPF3BQ9BZI7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UPF3BQ9BZI7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
UPF3BQ9BZI7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UPF3BQ9BZI7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
UPF3BQ9BZI7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms