Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PITPNM3Q9BZ71 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PITPNM3Q9BZ71 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PITPNM3Q9BZ71 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms