Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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KRTAP9-3Q9BYQ3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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