Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NIFKQ9BYG3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NIFKQ9BYG3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NIFKQ9BYG3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NIFKQ9BYG3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NIFKQ9BYG3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NIFKQ9BYG3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NIFKQ9BYG3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NIFKQ9BYG3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms