Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MRPL4Q9BYD3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MRPL4Q9BYD3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MRPL4Q9BYD3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MRPL4Q9BYD3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms