Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CACNG6Q9BXT2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNG6Q9BXT2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG6Q9BXT2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms