Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV20

MRI1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRI1Q9BV20 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRI1Q9BV20 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRI1Q9BV20 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRI1Q9BV20 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms