Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
THUMPD2Q9BTF0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
THUMPD2Q9BTF0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
THUMPD2Q9BTF0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
THUMPD2Q9BTF0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
THUMPD2Q9BTF0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
THUMPD2Q9BTF0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
THUMPD2Q9BTF0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
THUMPD2Q9BTF0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
THUMPD2Q9BTF0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
THUMPD2Q9BTF0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
THUMPD2Q9BTF0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
THUMPD2Q9BTF0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
THUMPD2Q9BTF0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
THUMPD2Q9BTF0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
THUMPD2Q9BTF0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
THUMPD2Q9BTF0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
THUMPD2Q9BTF0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
THUMPD2Q9BTF0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
THUMPD2Q9BTF0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
THUMPD2Q9BTF0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
THUMPD2Q9BTF0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
THUMPD2Q9BTF0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
THUMPD2Q9BTF0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
THUMPD2Q9BTF0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
THUMPD2Q9BTF0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
THUMPD2Q9BTF0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
THUMPD2Q9BTF0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
THUMPD2Q9BTF0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
THUMPD2Q9BTF0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
THUMPD2Q9BTF0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
THUMPD2Q9BTF0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
THUMPD2Q9BTF0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
THUMPD2Q9BTF0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
THUMPD2Q9BTF0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
THUMPD2Q9BTF0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
THUMPD2Q9BTF0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
THUMPD2Q9BTF0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
THUMPD2Q9BTF0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
THUMPD2Q9BTF0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
THUMPD2Q9BTF0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
THUMPD2Q9BTF0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
THUMPD2Q9BTF0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
THUMPD2Q9BTF0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
THUMPD2Q9BTF0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
THUMPD2Q9BTF0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms