Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
YIPF4Q9BSR8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF4Q9BSR8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF4Q9BSR8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms