Protein–RNA interactions for Protein: Q99961

SH3GL1, Endophilin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1Q99961 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3GL1Q99961 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SH3GL1Q99961 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3GL1Q99961 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms