Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF558Q96NG5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF558Q96NG5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF558Q96NG5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms