Protein–RNA interactions for Protein: Q96MM7

HS6ST2, Heparan-sulfate 6-O-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS6ST2Q96MM7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HS6ST2Q96MM7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HS6ST2Q96MM7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HS6ST2Q96MM7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HS6ST2Q96MM7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HS6ST2Q96MM7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HS6ST2Q96MM7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HS6ST2Q96MM7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HS6ST2Q96MM7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HS6ST2Q96MM7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HS6ST2Q96MM7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms