Protein–RNA interactions for Protein: Q96L50

LRR1, Leucine-rich repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRR1Q96L50 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRR1Q96L50 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LRR1Q96L50 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRR1Q96L50 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms