Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COX4I2Q96KJ9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX4I2Q96KJ9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX4I2Q96KJ9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms