Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC34Q96HJ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC34Q96HJ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC34Q96HJ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC34Q96HJ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms