Protein–RNA interactions for Protein: Q96B67

ARRDC3, Arrestin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC3Q96B67 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARRDC3Q96B67 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARRDC3Q96B67 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARRDC3Q96B67 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARRDC3Q96B67 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARRDC3Q96B67 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARRDC3Q96B67 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARRDC3Q96B67 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARRDC3Q96B67 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARRDC3Q96B67 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms