Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKD1Q969G9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NKD1Q969G9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD1Q969G9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms