Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWT9

SLC13A3, Solute carrier family 13 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3Q8WWT9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC13A3Q8WWT9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC13A3Q8WWT9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms