Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJA4Q8WW22 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJA4Q8WW22 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJA4Q8WW22 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms