Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFT2D1Q8WV19 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFT2D1Q8WV19 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D1Q8WV19 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms