Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE69

CXorf40A, Protein CXorf40A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40AQ8TE69 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXorf40AQ8TE69 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXorf40AQ8TE69 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXorf40AQ8TE69 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXorf40AQ8TE69 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXorf40AQ8TE69 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXorf40AQ8TE69 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXorf40AQ8TE69 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXorf40AQ8TE69 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXorf40AQ8TE69 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXorf40AQ8TE69 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CXorf40AQ8TE69 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CXorf40AQ8TE69 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CXorf40AQ8TE69 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CXorf40AQ8TE69 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CXorf40AQ8TE69 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXorf40AQ8TE69 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CXorf40AQ8TE69 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CXorf40AQ8TE69 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXorf40AQ8TE69 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXorf40AQ8TE69 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXorf40AQ8TE69 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CXorf40AQ8TE69 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CXorf40AQ8TE69 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXorf40AQ8TE69 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXorf40AQ8TE69 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXorf40AQ8TE69 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXorf40AQ8TE69 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXorf40AQ8TE69 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXorf40AQ8TE69 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXorf40AQ8TE69 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CXorf40AQ8TE69 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms