Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DTX3LQ8TDB6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DTX3LQ8TDB6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DTX3LQ8TDB6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DTX3LQ8TDB6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DTX3LQ8TDB6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DTX3LQ8TDB6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DTX3LQ8TDB6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DTX3LQ8TDB6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DTX3LQ8TDB6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DTX3LQ8TDB6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DTX3LQ8TDB6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DTX3LQ8TDB6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DTX3LQ8TDB6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DTX3LQ8TDB6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DTX3LQ8TDB6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DTX3LQ8TDB6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DTX3LQ8TDB6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
DTX3LQ8TDB6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DTX3LQ8TDB6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DTX3LQ8TDB6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DTX3LQ8TDB6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DTX3LQ8TDB6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DTX3LQ8TDB6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms